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Guide pratique 2026

Arrêt longue durée : droits, IJ et que faire après 3 mois

Un arrêt maladie qui dure plus de 3 mois, c'est une situation très différente d'un simple arrêt court. Les règles d'indemnisation changent, les droits évoluent, et certaines démarches deviennent urgentes à anticiper, notamment quand on approche de la limite des 360 jours d'IJ. Voici ce que vous devez savoir et préparer en 2026.

📅 Mis à jour le 📖 Lecture : 7 minutes ✅ Informations vérifiées, sources ameli.fr et service-public.fr

Les chiffres clés à retenir

360 j
Limite IJ ordinaire
Maximum d'IJ versées sur 3 ans pour un arrêt hors ALD
3 ans
Limite IJ en ALD
Les IJ peuvent être versées jusqu'à 3 ans pour une ALD
2/3
Seuil invalidité
Capacité réduite de 2/3 → droit à la pension d'invalidité

Ce qui change à partir de 3 mois d'arrêt

3M
Après 3 mois : premiers changements importants

Pour un salarié du privé, le maintien de salaire par l'employeur (prévu par la loi de mensualisation) commence à s'épuiser selon l'ancienneté. À 1 an d'ancienneté, le maintien légal est de 90 jours à 90 %, puis 90 jours à 66 %. Si la convention collective est plus favorable, ces durées peuvent être plus longues.

Pour un fonctionnaire en CMO, le passage au demi-traitement intervient dès le 91e jour, depuis la réforme de mars 2025, les 3 premiers mois sont à 90 % puis on bascule à 50 %.

Pour tout le monde, la visite médicale de reprise devient obligatoire si le retour au travail intervient, et le rendez-vous de liaison avec l'employeur peut être organisé.

6M
Après 6 mois : conditions d'affiliation plus strictes

Pour continuer à percevoir des IJ au-delà de 6 mois, des conditions d'affiliation plus strictes s'appliquent. Vous devez justifier d'au moins 12 mois d'affiliation à la Sécurité sociale à la date de l'arrêt, et avoir travaillé au moins 600 heures dans les 12 mois précédant l'arrêt (ou cotisé sur 2 030 × SMIC horaire).

Ces conditions sont automatiquement vérifiées par la CPAM, vous n'avez pas de démarche spécifique à faire, mais veillez à vous assurer que vos droits sont bien ouverts via votre espace Ameli.

La limite des 360 jours d'IJ

C'est le point le plus critique pour les arrêts longs. Pour un arrêt ordinaire (hors ALD), les IJ ne peuvent pas être versées plus de 360 jours sur une période de 3 ans. Ce compteur inclut tous les arrêts maladie cumulés sur la période, pas seulement un seul arrêt continu.

📅
Arrêt ordinaire
Maximum 360 jours sur 3 ans

Pour rouvrir un nouveau droit de 360 jours, vous devez avoir repris le travail pendant au moins 12 mois après l'épuisement de vos droits. Une période de chômage indemnisée ne compte pas comme reprise du travail.

🏥
ALD reconnue
Jusqu'à 3 ans d'IJ continues

Pour une affection longue durée (ALD) reconnue, les IJ peuvent être versées jusqu'à 3 ans de façon continue. Ce droit est renouvelable si vous reprenez le travail au moins 12 mois. Les IJ en ALD ne sont pas imposables.

⚠️ Surveillez votre compteur d'IJ ! Votre espace Ameli affiche le nombre de jours d'IJ déjà consommés et le solde restant. Vérifiez-le régulièrement si votre arrêt dure. Quand vous approchez de 300 jours consommés, commencez à préparer la suite, notamment la demande de pension d'invalidité si votre état de santé l'exige.

Récapitulatif selon la durée de l'arrêt

DuréeIJ versées ?Maintien salaire privéVisite médicale ?
0 à 30 joursOui (après carence)Selon anciennetéNon obligatoire
30 jours à 3 moisOuiSelon anciennetéObligatoire à la reprise
3 à 6 moisOuiPeut être épuiséObligatoire à la reprise
6 mois à 1 anOui (si 600h/12 mois)Souvent épuiséObligatoire à la reprise
Au-delà de 360 joursNon (sauf ALD)Passage en invalidité à envisager
ALD, jusqu'à 3 ansOui (non imposables)

Que se passe-t-il quand les IJ sont épuisées ?

C'est la situation la plus délicate. Quand les IJ arrivent à leur terme, plusieurs issues sont possibles selon votre situation médicale.

1
Demande de pension d'invalidité

Si votre capacité de travail est réduite d'au moins 2/3 par la maladie, vous pouvez demander une pension d'invalidité. Elle peut être initiée par votre médecin traitant, par la CPAM elle-même, ou par vous directement. La demande se fait avant l'épuisement des IJ, pas après, anticipez au moins 2 à 3 mois avant la fin de vos droits.

Pour en savoir plus : guide complet sur la pension d'invalidité.

2
Reprise du travail et visite médicale

Si votre état de santé s'est amélioré, la reprise du travail est l'autre issue. Elle implique obligatoirement une visite médicale de reprise avec le médecin du travail, qui peut préconiser un mi-temps thérapeutique si une reprise à temps plein est prématurée. Pour en savoir plus : guide sur la reprise du travail.

3
Inaptitude et licenciement

Si le médecin du travail vous déclare inapte à votre poste à l'issue de la visite médicale, l'employeur doit d'abord chercher à vous reclasser. Si c'est impossible, un licenciement pour inaptitude peut être engagé avec versement d'une indemnité spécifique.

Les démarches à anticiper pour un arrêt long

💡 Le dispositif "Help" pour les indépendants : si vous êtes travailleur indépendant en difficulté (financière, médicale, familiale), le dispositif "Help" regroupe l'Urssaf, la CAF, l'Assurance retraite et l'Assurance Maladie. Un questionnaire unique sur ameli.fr oriente vers l'organisme compétent pour votre situation.

✅ Checklist arrêt longue durée

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Questions fréquentes sur les arrêts longs

Pour un arrêt ordinaire (hors ALD), la limite est de 360 jours sur une période de 3 ans. Ce plafond cumule tous les arrêts maladie sur la période. Pour une ALD, les IJ peuvent être versées jusqu'à 3 ans de façon continue. Pour rouvrir un nouveau droit, il faut reprendre le travail au moins 12 mois.
Plusieurs issues sont possibles : demande de pension d'invalidité si la capacité de travail est réduite des 2/3, reprise du travail (avec visite médicale obligatoire), ou licenciement pour inaptitude si le médecin du travail le constate. La demande de pension doit être anticipée avant l'épuisement des droits.
Pour les salariés du privé, le maintien de salaire légal de l'employeur peut commencer à s'épuiser selon l'ancienneté. Pour les fonctionnaires, le traitement passe à 50 % (demi-traitement) à partir du 91e jour de CMO depuis la réforme de mars 2025. Au-delà de 6 mois, des conditions d'affiliation plus strictes s'appliquent pour les IJ (600h de travail sur 12 mois).
Connectez-vous à votre espace Ameli et consultez la rubrique "Mes droits". Vous y trouverez le nombre de jours d'IJ déjà consommés et le solde restant sur la période de 3 ans. Si vous approchez de 300 jours consommés, commencez à préparer la suite.
Oui. Pour une affection longue durée (ALD) reconnue par la CPAM, les IJ peuvent être versées jusqu'à 3 ans en continu, contre 360 jours maximum pour un arrêt ordinaire. De plus, les IJ en ALD exonérante ne sont pas imposables sur le revenu. Si votre pathologie peut être reconnue en ALD, demandez-le à votre médecin traitant.

En résumé

Un arrêt maladie de longue durée suit des règles précises. Pour un arrêt ordinaire, les IJ sont plafonnées à 360 jours sur 3 ans, au-delà, la pension d'invalidité prend le relais si votre capacité de travail est réduite de 2/3. Pour une ALD reconnue, vous pouvez percevoir des IJ jusqu'à 3 ans. Dès que vous approchez de 300 jours d'IJ consommés, anticipez : parlez à votre médecin de la pension d'invalidité, vérifiez si vous êtes éligible à l'ALD, et contactez un assistant social CPAM. Plus vous anticipez, mieux vous êtes protégé.

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